1、运用中的消毒剂应每季度进行生物监测1次，其细菌含量有必要≤100cfu/ml，不得检出致病性微生物；灭菌剂每月监测1次，不得检出任何微生物。
2、化学监测：应根据消毒、灭菌剂的功能定时监测，如含氯消毒剂、过氧乙酸等应每日监测；运用中的戊二醛应加强监测，惯例监测每周不少于1次。用于内镜消毒或灭菌的戊二醛有必要每日或运用前进行监测，并做好有关记录。
3、消毒物品每季度监测一次，不得检出致病性微生物；灭菌物品每月监测一次，不得检出任何微生物。
4、运用紫外线灯管和空气消毒机消毒应进行平时监测、紫外线灯管照耀强度监测和生物监测。平时监测包含灯管应用时刻、累计照耀时刻和运用人签名；对新灯管和运用中灯管应进行照耀强度监测，30W一般石英新灯管的照耀强度不得低于90uW/cm2，运用中灯管不得低于70uW/cm2 ，每半年监测一次；生物监测必要时进行，经消毒后的物品或空气中的天然菌应削减90%以上，人工染菌杀灭率应到达99.90%；
5、各种消毒后的内镜（如胃镜、气管镜等）及其消毒物品应每季度进行生物学监测。其合格规范为：细菌总数≤20cfu/件,不能检出致病菌。凡穿破黏膜的内镜附件如活检钳、高频电刀、细胞刷、切开刀、异物钳等灭菌物品有必要每月进行生物监测；不得检出任何微生物。
6、环境卫生学监测：包含对空气、物体外表和医护人员手的监测，一般病房每季度进行监测。要点部分每月进行检查。当怀疑医院传染与环境卫生学要素有关时，应及时进行监测。监测办法及卫生学规范应契合《医院消毒卫生规范》（GB15982-2010）。
